回答募集同一サーバーID内でのサイトリニューアルについて

同一サーバーID内で、サイトをリニューアルするための手順を教えてください。
現在稼働中のaaa.comのリニューアルをするために、一旦aaa_dev.comで制作しています。

現行のaaa.comはkohanaというcodeigniter系のフレームワークを使用しており
リニューアル後のaaa_dev.comはlaravelで制作しています。

リニューアル後のサイトが完成したので、ドメインの向きを変更しようと思ったのですが
xserverはディレクトリ名と紐づいているため、少しややこしそうです。

リニューアルの開発環境用のドメイン取得して、本番に反映するシチュエーションって
割とよくあると思いますが、皆さんはどのようにリニューアル作業をしているのでしょうか？

ディレクトリを丸ごと差し替えはあまりしたくないなと考えています。

皆様のお力添えお願いいたします。