アカウントデーターについて

総ファイル数が多すぎるとサーバー自体が正常な動作をしない可能性があるので可能な限り不要なファイルを削減したほうがよいです。
どのような影響があるのかなどの詳細は下記ブログにてまとめられていたものがわかりやすいのでご参照ください。

■エックスサーバーの「総ファイル数」の警告
https://affilife.sainoa.com/archives/11866.html

どのファイルを削除すればよいかというのは運用方法次第となるので、具体的なアドバイスは難しいですが、よくあるものとしてバックアップデータやメールデータなどが挙げられるので不要なバックアップ、メールについては削除する。削除できないが今利用するものではないのであれば自身の端末側へ退避するなどでサーバー上のファイル数の削減を行うことをおすすめします。